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| 多种类型微生物-有机物质发酵存在不同发酵途径 |
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多种类型微生物-有机物质发酵存在不同发酵途径在任何一种环境下，都不可能只存在一种类型的微生物，而共存的多种类型的微生物之间肯定存在着正面或负面的相互影响。产甲烷生物反应器这一厌氧生态系统是以其复杂的食物链为特点，并且在食物链上不同成分之间存在密切的共生关系。产甲烷菌群也常被作为一个典型的共生生态系统，在这一生态系统中，生物体以其上一级消费者的代谢产物为食，而非相互取食。产氢微生物和耗氢微生物之间的共生关系仅限于一定的氢分压范围之内，超过这个范围，其中的相互作用体中的某一方就可能会受到热力学方面的不利影响而失去共生关系。这种情况可能发生在高负荷的易降解化合物的消化中，也可能由抑制性化合物的潜在作用引起。消化反应器中，抑制甲烷产生的化合物通过两种途径发挥作用：一是在厌氧降解过程中微生物直接作用；二是刺激其他微生物大量生长，让它们同产甲烷菌或者同在降解反应链中处于产甲烷菌之前的微生物形成竞争，来降低甲烷的产量和造成其他不利影响。 两种或多种微生物之间的竞争关系是一种不利关系，因为它们会对彼此的生存和生长造成不利影响。竞争也被认为是生物体之间重要的一种关系，是能够说明导致物种进化的选择性压力的主要依据。 厌氧菌之间的竞争关系可被大致分为动力学竞争和热力学竞争动力学竞争指的是，在忽略热力学竞争可能成为潜在机制的情况下，通过对微生物的生长进行动力学测量，来检测其竞争能力。热力学竞争是指一种生物体之所以能够在低于小底物浓度(阈值浓度)的条件下生长，是因为在物质转化的过程中，微生物能够摄取其他生物体所产生的更高的能量。 有机物质的厌氧发酵过程存在有不同的发酵途径，不同途径的联合作用所产生的能量也各不相同。然而，因为厌氧发酵是微生物细胞为获得大的能量和优的氧化还原平衡而对自身进行的内在优化，不同途径所产生的能量其实是等量的。这就造成了这样的一个结果：发酵中的竞争性相互影响主要是动力学特点决定的。大多数对厌氧发酵微生物之间的竞争性的研究主要是针对胃肠道系统的，所知的研究只有很少针对的是厌氧消化过程。
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