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生物学体结晶学小分子结构技术的应用-生物硬度计
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生物学体结晶学小分子结构技术的应用-生物硬度计  在生物学体系里,晶胞可能拥有内部的对称性,不止一个的蛋白质分子通过对称轴或对称面与其他分子发生联系。一系列的对称操作使下个晶胞内的原子发生相配,并且包含了诸如平面内平移、绕轴旋转、反射(像在镜子里)、同步旋转和倒置。空问基团被认为可以用来定义特殊晶体排列的对称操作,通过230个由国际结晶学协会发表的已经被确认的空间基团,在大多数的排列中(而非全部)发现了晶体。  散射取决于晶格的特性,是入射X射线和晶体中原子电子之间相互作用的结果。所以,铁、铜等金属原子和硫等原子对散射X射线非常敏感,而较小的原子如质子对散射X射线就不敏感。X射线衍射实验的终结果并不是一个原子图,而是一个分子中电子的分布图,它是一个电子密度图。尽管如此,由于电子很紧密地分布在原子核子周围,所以电子密度图是分子内原子定位的很好的近似图。  X射线对单分子的衍射可能包含仅仅一个或一小部分电子密度中心,这个使测量和从环境干扰中分辨比较困难。晶体的一个优点就是巨大数目的分子都朝向同一个方向。排序的影响就是增强了散射信号(反射)的强度。位相散射的条件可以看做是那些穿过晶体中被收集的来自或离开原子平面上的X射线的反射。  结晶学者们在研究小分子结构时,很容易关于分子构象做一些“猜想”。通过为这些“猜想”计算衍射图来对比实验结果和理论结果。如果猜想中原子的定位大概是正确的,那么计算出的相位就几乎是正确的,而且把观察到的振幅和计算出的相位结合起来,我们就可以计算出有用的电子密度图。在这个经验式中,我们有可能成功地重新定义模型,直至得到满意的结构。这些直接的方法对小分子晶体结构非常合适,不过却不适用于蛋白质。

 


 
 
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